单克隆抗体碎片在水-油界面上的吸附:一个粗粒度的分子动力学研究
Suman Saurabh1, Li Lei1, Zongyi Li2
1Department of Chemistry, Molecular Sciences Research Hub, Imperial College, W12 0BZ London, United Kingdom.
APL bioengineering
|July 1, 2024
概括
在油水接口的单克隆抗体 (mAb) 吸附会导致结构变化并降低治疗效果. 分子动力学模拟揭示了驱动吸附和结构扭曲的蛋白质区域,有助于接口管理策略.
科学领域:
- 生物物理学的生物物理.
- 蛋白质化学 蛋白质化学
- 计算生物学 计算生物学
背景情况:
- 在储存过程中,单克隆抗体 (mAbs) 容易受到油水接口的结构变化.
- 这些变化可能导致聚合和治疗疗效的丧失.
- 了解mAb-接口相互作用对于保存治疗性质至关重要.
研究的目的:
- 在油水界面研究单克隆抗体 (mAb) 吸附的微观机制.
- 确定负责mAb吸附的特定蛋白质表面区域.
- 检查蛋白质度对mAb方向和油相突起的影响.
主要方法:
- 使用了MARTINI粗粒度分子动力学模拟.
- 模拟了单克隆抗体 COE3.3 的 Fab 和 Fc 域的吸附.
- 分析了油水界面上的蛋白质结构,定向和突出.
主要成果:
- 确定了驱动mAb吸附的关键蛋白质表面区域.
- 观察到接口附近的二次扩散层,与单层中子反射率预测不同.
- 发现蛋白质 - 油相互作用可以导致蛋白质结构的显著扭曲,增强吸附.
结论:
- 分子动力学模拟提供了对界面上的mAb吸附机制的见解.
- 在某些条件下,蛋白质结构的扭曲可以增强吸附.
- 发现有助于制定策略,以减轻治疗 mAbs.的界面诱导退化.
