相关实验视频
Updated: Jun 22, 2025

Detection of Copy Number Alterations Using Single Cell Sequencing
Published on: February 17, 2017
在小麦中标记大型CNV块可以通过超低覆盖范围的测序来促进生殖质资源的数字化
Jianxia Niu1,2, Wenxi Wang1, Zihao Wang1,2
1Frontiers Science Center for Molecular Design Breeding, Key Laboratory of Crop Heterosis and Utilization, Beijing Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, China Agricultural University, Beijing, 100193, China.
我们开发了复制数变异块 (CNVb) 作为用于小麦品种识别的DNA指纹. 这种数字CNVb地图有助于管理小麦胚胎质和改进育种策略.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 植物科学 植物科学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 小麦的遗传多样性是由结构变异和内进而形成的.
- 小麦的复杂多倍体基因组挑战了用于生殖质管理的高效基因定型.
研究的目的:
- 开发一种使用副本数变异区块 (CNVb) 的小麦新型基因定型方法.
- 创建一个数字化的CNVb地图,用于大规模的小麦生殖质分析和管理.
主要方法:
- 在小麦泛基因组中识别了1240个高质量的大型CNV块.
- 为1599个全球小麦加入建立数字化CNVb基因型测定地图.
- 使用PCR测定验证CNVb标记物,并与特征相关的内向性相关联.
主要成果:
- CNVb被确定为有效的DNA指纹标记,用于区分小麦品种.
- 开发数字化CNVb地图,将标记物与重要的农学特征和等位基因联系起来.
- 证明CNVb在超低覆盖度测序中的实用性,用于成本效益高的生殖质评价.
结论:
- 基于CNVb的基因型定型为小麦生殖质评价提供了一个稳定,具有成本效益和高通量策略.
- 开发的平台 (WheatCNVb) 便于在小麦育种中实现数字化管理和精确的决策.
- 这种方法支持高效的基因库管理和小麦资源的数字描述.
更多相关视频
09:32An Array-based Comparative Genomic Hybridization Platform for Efficient Detection of Copy Number Variations in Fast Neutron-induced Medicago truncatula Mutants
Published on: November 8, 2017
09:06High-throughput Identification of Gene Regulatory Sequences Using Next-generation Sequencing of Circular Chromosome Conformation Capture 4C-seq
Published on: October 5, 2018
相关概念视频
Genome-wide Association Studies-GWAS
GWAS does not require the identification of the target gene involved in...
RNA-seq
Before the discovery of RNA-seq, microarray-based methods and Sanger sequencing were used for transcriptome analysis. However, while...