在膀癌中通过生物信息学和实验分析识别和验证基转移酶ST3Gal5
Yuli Jian1, Qiwei Chen2, Abdullah Al-Danakh3
1Department of Urology, First Affiliated Hospital of Dalian Medical University, Dalian Medical University, Dalian 116011, China; Liaoning Provincial Core Lab of Glycobiology and Glycoengineering, College of Basic Medical Sciences, Dalian Medical University, Dalian 116044, China.
转移酶ST3Gal5的低表达促进了膀癌 (BLCA) 的进展和瘤发生. 这表明ST3Gal5可以作为BLCA患者的预测生物标志物和治疗标.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 膀癌 (BLCA) 是一种全球普遍存在的恶性瘤.
- 在癌症的发展和免疫反应中经常观察到异常的化.
- 基转移酶ST3Gal5在BLCA中的作用仍未得到充分研究.
研究的目的:
- 为了研究基转移酶ST3Gal5对膀癌的影响.
- 为了确定ST3Gal5在BLCA中的预后值.
- 探索ST3Gal5表达和瘤免疫微环境之间的关系.
主要方法:
- 对TCGA-BLCA和GEO数据集的生物信息分析,以识别与糖氨基转移酶相关的差异表达基因 (GRDEG).
- 考克斯回归分析以确定ST3Gal5作为一个独立的预后因素.
- 使用CIBERSORT,ssGSEA,TIDE和IPS得分评估免疫细胞透,HLA和免疫检查点基因表达,药物敏感性和ICB反应.
- 在体内和体外功能实验以阐明ST3Gal5的生物功能.
主要成果:
- 在BLCA组织和细胞中,ST3Gal5表达显著下调,与预后不佳相关.
- 在低ST3Gal5组中观察到升高的StromalScore,ImmuneScore和ESTIMATEScore.
- 在低ST3Gal5组中发现了HLA和免疫检查点基因的升级水平.
- 下调ST3Gal5增强了BLCA细胞的增殖,迁移和入侵.
结论:
- 低ST3Gal5表达促进膀癌的瘤发生和进展.
- ST3Gal5显示了作为BLCA预测生物标志物的潜力.
- ST3Gal5代表了膀癌治疗的潜在治疗标.
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