pyCEPS:一个跨平台的电解剖学映射数据到计算模型转换平台,用于对心脏电生理学数字双胞胎模型的校准
Robert Arnold1, Anton J Prassl1, Aurel Neic2
1Gottfried Schatz Research Center, Division of Medical Physics and Biophysics, Medical University of Graz, Graz, Austria.
Computer methods and programs in biomedicine
|July 3, 2024
概括
我们开发了pyCEPS,这是一个开源平台,可以轻松将临床电解剖绘图 (EAM) 数据转换为可用于心脏建模的格式. 该工具有助于对特定患者的数字双胞胎进行校准,并进行in silico研究.
科学领域:
- 计算生物学 计算生物学
- 医疗信息学 医疗信息学
- 生物医学工程 生物医学工程
背景情况:
- 在计算建模中,电解剖绘图 (EAM) 数据对于患者特定的数字双胞胎校准至关重要.
- 从商业EAM系统中获取和分析数据存在重大挑战.
- 将EAM数据转换为与openCARP等心脏模拟软件兼容的格式是困难的.
研究的目的:
- 开发一个开源平台,pyCEPS,用于无分析和转换临床EAM数据.
- 为了促进EAM数据的整合到心脏建模工作流程中.
- 通过使用临床数据,实现数字双胞胎模型的患者特定校准.
主要方法:
- 开发了pyCEPS,这是一个基于Python的开源平台.
- 实现了访问,查询和浏览EAM数据的功能.
- 启用了EAM数据的转换,以开放CARP标准格式进行分析.
主要成果:
- pyCEPS提供了有效的临床EAM数据的访问和转换.
- 该平台允许预览映射程序,电图 (EGM) 和心电图 (ECG).
- 证明了pyCEPS在从临床成像数据中构建患者特定的解剖模型中的实用性.
结论:
- pyCEPS提供了一个重要的开源框架,用于将EAM数据集成到心脏建模研究中.
- 该平台简化了使用EAM数据对计算模型的校准.
- 为心脏研究和数字双胞胎开发提供先进的in silico工作流.
