超越COVID-19:基于废水的流行病学,用于多病原体监测和规范化策略
Bikash Malla1, Sadhana Shrestha1, Niva Sthapit1
1Interdisciplinary Center for River Basin Environment, University of Yamanashi, 4-3-11 Takeda, Kofu, Yamanashi 400-8511, Japan.
The Science of the total environment
|July 3, 2024
概括
废水监测有效追踪了SARS-CoV-2,流感A和诺罗病毒,病毒载量在冬季达到峰值. 将病原体数据规范化为便指标,如大肠杆菌,改善了与疾病病例的相关性,突出了WBE.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 公共卫生监督是对公共卫生的监督.
- 分子流行病学分子流行病学
背景情况:
- 基于废水的流行病学 (WBE) 对社区健康监测至关重要.
- 虽然SARS-CoV-2的监测是常见的,但监测其他病原体,如A型流感和诺罗病毒至关重要.
- 了解废水中病原体的流行有助于预测和管理公共卫生威胁.
研究的目的:
- 在废水中量化SARS-CoV-2,流感A (Inf-A) 和诺罗病毒 (GI,GII).
- 评估季节性趋势和病毒载量与报告病例之间的相关性.
- 评估WBE数据的不同规范化方法的有效性.
主要方法:
- 在七个月的时间里 (2023年7月 - 2024年2月) 从五个污水处理厂每周取样.
- 定量PCR (qPCR) 用于检测和量化病毒RNA (SARS-CoV-2,Inf-A,NoV-GI,NoV-GII) 的数量.
- 分析了病毒度,并没有正常化到便指标 (大肠杆菌,大肠杆菌总体),指标病毒 (PMMoV) 和度.
主要成果:
- 高频率的NoV-GI (94%) 和NoV-GII (100%),其中GII度超过GI.
- 在100%的样本中检测到SARS-CoV-2;Inf-A显示局部爆发 (59-82%的流行率).
- 所有病毒都在冬季达到峰值;对大肠杆菌和全肠杆菌的正常化显著改善了与分别流感和胃肠炎病例的相关性.
结论:
- WBE是一种多功能工具,用于监测SARS-CoV-2以外的多种病原体.
- 对特定便指标的正常化对于准确的WBE疾病趋势分析至关重要.
- 选择适当的规范化参数可以提高WBE在公共卫生监测中的可靠性.
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