阴道样品的运输与立即冷储存的比较,用于评估阴道微生物群

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 遗传学 是一个遗传学.
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 阴道微生物群的研究通常需要立即处理或冷样本.
• 简化样本采集和运输对于大规模研究和临床应用至关重要.
• 目前的阴道样品保存方法在家庭或野外采集方面可能具有后勤挑战性.

研究的目的:

• 评估室温储存对稳定溶液与立即冷对阴道微生物群的16SrRNA基因安普利康测序的影响.
• 确定使用家庭性阴道样本采集与邮寄运输用于微生物群分析的可行性.
• 在模拟的航运条件下评估细菌丰度和社区状态类型 (CST) 的稳定性.

主要方法:

• 20名参与者自行收集了存储在两种不同的核酸防腐剂 (溶液C2,Amies/RNALater) 中的阴道拭子.
• 样品要么立即冷 (-80°C),要么在室温下运送平均8天.
• 阴道微生物组合被分析使用16S rRNA基因扩增序列,社区状态类型 (CST) 被VALENCIA分配,细菌丰度通过qPCR量化.

主要成果:

• 在运输和立即冷的样本之间观察到CST的完全一致性,用于两个防腐剂溶液 (科恩的卡帕: 1.0).
• 在运送和冷样本之间的分类层微生物群组成中没有发现显著差异.
• 通过泛细菌qPCR测量的细菌丰度也显示,储存条件之间没有显著差异.

结论:

• 在稳定溶液中短期发送阴道拭子的室温不会损害阴道微生物群的组成.
• 在家收集阴道样本,然后通过邮寄运输是研究和临床评估阴道微生物群的可行和可靠方法.
• 这种方法为扩大阴道微生物群研究的范围和改善参与者的可访问性提供了实际解决方案.