针对传染病的下一代定向测序的临床诊断价值 (综述)
Qiuyue Chen1, Jie Yi1, Yiwei Liu1
1Department of Laboratory Medicine, Peking Union Medical College Hospital, Chinese Academy of Medical Sciences, Beijing 100000, P.R. China.
Molecular medicine reports
|July 4, 2024
概括
针对性下一代测序 (tNGS) 为临床诊断中的病原体检测提供了一种敏感而实用的方法. 这种方法在识别耐药菌株和改善传染病管理方面表现出色.
科学领域:
- 临床诊断 临床诊断 临床诊断
- 传染病研究传染病研究.
- 基因组测序技术 基因组测序技术
背景情况:
- 基因组下一代测序 (mNGS) 在临床环境中越来越多地被采用.
- 对于具有成本效益和可访问的测序分析的需求越来越大.
- 有针对性的NGS (tNGS) 正在成为一种实用和高效的替代方案.
研究的目的:
- 在tNGS中比较不同病原体丰富方法的原理.
- 评估tNGS的临床应用和局限性.
- 评估tNGS在改善传染病管理方面的潜力.
主要方法:
- 对tNGS不同缩方法的原则的审查.
- 在各种临床样本类型中分析tNGS性能.
- 对tNGS用于检测耐药病原体的评估,包括* Mycobacterium tuberculosis*.
主要成果:
- tNGS在呼吸道样本中显示出高的阳性率.
- 在血液和脑脊液等低病原体负载样本中,tNGS保持高灵敏度 (70.895.0%).
- tNGS有效地识别了耐药的 * Mycobacterium 结核病 * 菌株,帮助治疗决策.
结论:
- tNGS显示出改进诊断准确性和治疗疗效的巨大潜力.
- 需要进一步的研究来应对工作流程时间和成本等挑战.
- 继续开发tNGS可以加强传染病管理.


