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Updated: May 5, 2026
13:17
Microarray Analysis for Saccharomyces cerevisiae
Published on: April 7, 2011
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关于Saccharomyces cerevisiae的基因组序列数据CBS 493.94 的数据
Ivana Nikodinoska1, Colm A Moran2
1Alltech European Headquarters, Sarney, Summerhill Road, Dunboyne, Co. Meath, Ireland.
Data in brief
|July 5, 2024
概括
全基因组测序证实了Saccharomyces cerevisiae CBS 493.94的身份,这是用于动物料的酵母菌株. 安全性评估发现没有涉及基因,包括抗菌素耐药性基因.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 酵母研究的酵母研究.
背景情况:
- 细菌菌 (Saccharomyces cerevisiae) CBS 493.94是一种具有历史意义的成熟酵母菌株,起源于1958年的一家英国酒厂.
- 这种菌株被广泛用作料添加剂,有助于改善动物健康.
- 为了确保其安全性和有效性,全面的基因组数据和菌株识别至关重要.
研究的目的:
- 在Saccharomyces cerevisiae CBS 493.94.4.上进行全基因组测序 (WGS).
- 使用多个遗传标记来明确识别菌株.
- 通过选潜在的令人担忧的基因来评估菌株的安全性,例如与抗菌素耐药性相关的基因.
主要方法:
- 整个基因组测序使用长读 (PacBio Sequel) 和短读 (Illumina NovaSeq 6000) 技术进行.
- 使用18S rRNA测序,平均核酸标识 (ANI) 树图分析和核心基因组单核酸多态 (SNP) 树结构进行了菌株鉴定.
- 序列数据被存储在NCBI (PRJNA1044661) 中,混合组件通过Zenodo和NCBI公开提供.
主要成果:
- 基因分析证实,该分离物属于Saccharomyces cerevisiae物种.
- 在基因组中没有检测到与抗菌素耐药性相关的基因.
- 对FKS1基因的具体分析显示,没有涉及氨基酸变体.
结论:
- 整个基因组测序提供了Saccharomyces cerevisiaeCBS 493.94.4的最终鉴定.
- 没有检测到令人担忧的基因支持该菌株作为料添加剂的预期用途的安全概况.
- 这些基因组数据增强了对这种重要的酵母菌株在动物健康中的理解和可靠应用.
