实施ABCD研究R MRI序列用于多站点队列研究:必要步骤,预处理方法和挑战的实用指南
Wajiha Bano1,2,3, Elmo Pulli1,2,3, Lucia Cantonas4
1FinnBrain Birth Cohort Study, Turku Brain and Mind Center, Department of Clinical Medicine, University of Turku, Turku, Finland.
MethodsX
|July 5, 2024
概括
跨站点的磁共振成像 (MRI) 协议的标准化提高了神经科学研究的可靠性. 微小的调整和集装箱管道改善了多站点研究的数据一致性.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 医疗成像医学成像
背景情况:
- 多位磁共振成像 (MRI) 研究为推进神经科学提供了重大潜力.
- 扫描仪的变化和非标准化的协议可能会损害MRI衍生脑部测量的可靠性和可重复性.
研究的目的:
- 在多个站点和扫描仪上实施和评估标准化的MRI协议.
- 评估标准化对数据质量和多站点研究的测试-重新测试可变性的影响.
主要方法:
- 基于青少年大脑认知发展 (ABCD) 研究的标准化MRI协议在两个站点和四台MRI扫描仪 (西门子,飞利浦,GE) 上实施.
- 数据包括解剖扫描 (T1,T2加权),扩散加权成像 (DWI) 和静止状态功能性MRI (rs-fMRI).
- 标准化,容器化管道用于数据预处理,评估图像质量指标和测试-重新测试可变性.
主要成果:
- 通过对扫描仪特定的技术变化 (例如,重复时间,b值,DICOM导出) 进行轻微调整,实现了标准化MRI协议的成功实施.
- 容器化预处理管道显示了多站点数据管理的好处.
- 对图像质量指标和测试-重新测试可变性的评估为不同扫描仪和站点的协议性能提供了洞察力.
结论:
- 标准化MRI协议和容器化数据处理对于提高多站点神经科学研究的可靠性至关重要.
- 需要仔细优化图像采集参数,以减轻扫描器诱导的变化.
- 这项工作为实施强大的多站点神经成像研究提供了实际指导.
