在中国中部,基于E6,E7和L1基因的人类乳头瘤病毒18型的遗传变异性
Ting Li1, Zhiping Yang1, Ping Luo1
1Department of Laboratory Medicine, Jingzhou Hospital Affiliated to Yangtze University, Jingzhou, 434020, China.
Virology journal
|July 5, 2024
概括
对人类乳头瘤病毒18型 (HPV18) E6-E7和L1基因的分析揭示了影响表位的序列变异. 这些数据对于中国的HPV诊断,宫癌研究和疫苗开发至关重要.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 基因组学就是基因组学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 高风险的人类乳头瘤病毒 (HR-HPV) 感染是导致子宫癌的主要原因.
- 在全球范围内,HPV18是第二个最常见的HR-HPV类型,仅次于HPV16.
研究的目的:
- 分析HPV18 E6-E7和L1基因的遗传变异和遗传学关系.
- 研究对这些基因的选择性压力,并预测潜在的B细胞和T细胞表位.
主要方法:
- MEGA11软件用于序列变异和家族遗传分析.
- pamlX用于估计选择性压力.
- 用ABCpred和IEDB进行表位预测.
主要成果:
- 在E6-E7中确定了9种变异 (2种非同义,7种同义) 和L1中20种 (11种非同义,9种同义).
- 遗传学分析将所有序列置于A血统内.
- 没有检测到任何阳性选择部位;在L1,E6和E7的特定替代影响了预测的表位.
结论:
- HPV18 序列变异数据为改善诊断提供了基础.
- 这些发现支持对子宫癌机制的进一步研究.
- 鉴定的变异和受影响的表位与中国中部HPV疫苗设计有关.
关键词:
E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E6 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7 E7E7 和 L1 基因.皮层预测预测的预测人类乳头瘤病毒 (HPV) 18变种 变种 变种 变种相关概念视频
Single Nucleotide Polymorphisms-SNPs
15.0K
A single nucleotide polymorphism or SNP is a single nucleotide variation at a specific genomic position in a large population. It is the most prevalent type of sequence variation found in the human genome. Point mutations that occur in more than 1% of the population qualify as SNPs. These are present once every 1000 nucleotides on an average in the human genome. Replacement of a purine with another purine (A/G) or a pyrimidine with another pyrimidine (C/T) is known as a transition. In contrast,...
15.0K
Non-LTR Retrotransposons
11.5K
As the name suggests, non-LTR retrotransposons lack the long terminal repeats characteristic of the LTR retrotransposons. Additionally, both LTR and non-LTR retrotransposons use distinct mechanisms of mobilization. Non-LTR retrotransposons are further divided into two classes - Long interspersed nuclear elements (LINEs) and short interspersed nuclear elements (SINEs), both of which occur abundantly in most mammals, including humans. Some of the active non-LTR retrotransposons in humans are L1...
11.5K


