网络分析预测番茄中对早期炎症综合体耐药性的主要调节者

科学领域:

• 植物病理学 植物病理学
• 分子生物学分子生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 由Alternaria spp.引起的早期腐烂和棕色叶斑是对番茄生产的主要威胁.
• 目前的商业番茄品种具有定量耐药性,但杀菌剂的使用仍然是必要的.
• 遗传复杂性阻碍了对这些死性病原体的有效抵抗繁殖.

研究的目的:

• 分析番茄 (海因茨1706) 在感染毒性和弱毒性Alternaria spp.时的转录反应. 孤立的. 孤立的.
• 确定参与番茄防御和易感性的关键调节器和转录模块.
• 改善番茄中的功能基因注释,以更好地了解植物病原体相互作用.

主要方法:

• 对海因兹1706番茄的转录组测序受到不同Alternaria spp.的挑战. 孤立的. 孤立的.
• 在番茄中扩展现有的功能基因注释.
• 网络统计和共同表达分析以确定转录模块和监管网络.

主要成果:

• 针对对弱毒性和强毒性分离物的反应,确定了不同的转录模块.
• 弱毒性分离物诱导了一种涉及信号,激素反应和转录因子的防御反应模块.
• 强烈毒性分离物引起的反应较弱,单独的模块缺乏激素信号传递.

结论:

• 确定了主要的防御调节器和番茄功能分析的潜在目标.
• 对Alternaria的防御涉及特定的免疫路径和激素反应的调节.
• 乙烯反应因子 (ERF) 和酸 (JA) 信号都与宿主防御调节有关.