通过生物信息学分析和机器学习,识别和验证 papillary 甲状腺癌和 Hashimoto 甲状腺炎的潜在常见生物标志物
Hui Jiang1, Yanbin He2,3, Xiaofeng Lan1
1Department of Ultrasound, The Second Affiliated Hospital of Anhui Medical Universty, Hefei, 230601, Anhui, China.
Scientific reports
|July 6, 2024
概括
哈西莫托的甲状腺炎 (HT) 可能会增加乳头甲状腺癌 (PTC) 的风险. 研究人员确定了三个关键基因 (CD53,FCER1G,TYROBP) 是两种疾病共同的,这表明它们有可能成为诊断标记物和治疗点.
科学领域:
- 内分泌学 在内分泌学.
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 哈西莫托甲状腺炎 (HT) 越来越多地与乳头甲状腺癌 (PTC) 风险有关.
- 连接HT和PTC的精确分子机制尚不清楚.
研究的目的:
- 确定与HT和PTC相关的共享生物标志物.
- 探索这些生物标志物的潜在诊断和治疗作用.
主要方法:
- 分析公开可用的基因表达数据集 (GEO,TCGA).
- 差异表达基因 (DEGs) 的鉴定,通路丰富分析 (GO,KEGG).
- 蛋白质与蛋白质相互作用网络分析,枢纽基因选择 (随机森林) 和诊断模型开发 (ANN).
主要成果:
- 确定了101种常见的DEG,富含炎症和免疫通路.
- 他们确定了6个显著模块和3个枢纽基因 (CD53,FCER1G,TYROBP).
- 使用这些基因的人工神经网络模型显示出高性能,CD53是最有影响力的. 免疫细胞失调也被观察到.
结论:
- CD53,FCER1G和TYROBP都与HT和PTC的发展和进展有关.
- 这些基因代表了两种疾病的潜在诊断标记物和治疗点.
- 进一步的研究可能会探索对HT和PTC的治疗方法,例如基基基聚氨酸和阿司匹林.
