来自真实菌株的SARS-CoV-2尖端蛋白的高度特异性吸收体
Maria G Khrenova1,2, Lyudmila Nikiforova1, Fedor Grabovenko1
1Chemistry Department, Lomonosov Moscow State University, 119991 Moscow, Russia. khrenovamg@my.msu.ru.
Organic & biomolecular chemistry
|July 8, 2024
概括
一种新型的DNA吸收体,MEZ,专门结合SARS-CoV-2尖端蛋白.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 生物化学 生物化学
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- DNA 体为分子识别提供了抗体的替代品.
- SARS-CoV-2尖端蛋白的受体结合域 (RBD) 是诊断和治疗的关键目标.
研究的目的:
- 鉴定和描述一种具有高特异性的新型DNA吸收体,用于SARS-CoV-2 武汉-胡-1 RBD.
- 阐明已识别的aptamer的结合机制和菌株特异性识别.
主要方法:
- 通过指数式丰富 (SELEX) 系统进化基对体选择.
- 纳米孔测序用于aptamer识别.
- 化学合成和生物物理特征的aptamer (例如,K_d的确定).
主要成果:
- 鉴定了具有高亲和度 (K_d = 6.5 nM) 的MEZDNA合体,用于武汉-胡一 SARS-CoV-2 RBD.
- 已证明与特定菌株结合;MEZ不会与来自Beta,Delta或Omicron变种的RBD结合.
- 揭示了MEZ合酶与ACE2结合到相同的部位,并确定了关键的功能区域 (特异性为3'-end,结构为5'-end).
结论:
- 这种MEZ体是祖先SARS-CoV-2 RBD的强大和特定的结合剂.
- 它的菌株特异性和小尺寸使其成为诊断和治疗应用的有希望的候选者.
- 了解结合机制为aptamer设计提供了洞察力.


