工业规模的多任务ADME/PK预测:利用大型和多样化的实验数据集
Moritz Walter1, Jens M Borghardt2, Lina Humbeck1
1Medicinal Chemistry Department, Boehringer Ingelheim Pharma GmbH & Co. KG, Birkendorfer Str. 65, 88397, Biberach an der Riss, Germany.
Molecular informatics
|July 8, 2024
概括
多任务机器学习模型显著改善了药物吸收,分布,新陈代谢和分泌 (ADME) 和动物药物动力学 (PK) 概况的预测. 在多个终点上利用数据可以提高模型的准确性,特别是当先前的实验结果可用时.
科学领域:
- 药物的发现和开发.
- 计算化学是一种计算化学.
- 药理动力学 药理动力学
背景情况:
- 吸收,分发,新陈代谢和分泌 (ADME) 属性对于候选药物成功至关重要.
- 药代动力学 (PK) 概况决定了药物在人体中的行为.
- 早期预测ADME和PK属性对于有效的药物开发至关重要.
研究的目的:
- 评估用于预测ADME和动物PK终点的多任务机器学习 (ML) 模型.
- 将多任务模型与单任务模型的性能进行比较.
- 了解如何利用跨多个终点的内部数据影响预测准确度.
主要方法:
- 开发和应用基于多任务图形的神经网络模型.
- 培训模型是基于博林格英格尔海姆公司内部的ADME/PK数据.
- 评估模型使用现实的时间分割,考虑设计和测试阶段.
主要成果:
- 与单一任务模型相比,多任务的ML模型表现出更高的性能.
- 多任务学习的好处在早期测试的实验数据可用时更为明显.
- 具有更广泛数据的终点,如物理化学性质和微体清除,有助于改善复杂ADME/PK终点的预测性.
结论:
- 多任务学习有效地利用药物环境中的多个ADME/PK终点的数据.
- 基于图形的神经网络显示出增强ADME/PK预测的巨大潜力.
- 在测试中优化内部数据的使用可以显著提高ML模型在药物发现中的预测性.
关键词:
ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME ADME机器学习 机器学习多任务学习是多任务学习.药理动力学 药理动力学在QSAR中使用QSAR.更多相关视频
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