生成和分析高参数组织学图像与组织流细胞计
Rajiv W Jain1, David A Elliott2, V Wee Yong3
1Hotchkiss Brain Institute, University of Calgary; Department of Clinical Neurosciences, University of Calgary.
Journal of visualized experiments : JoVE
|July 8, 2024
概括
组织流细胞计提高了组织成像,使免疫细胞的高参数分析. 这种方法允许组织内免疫细胞子集的详细分析和空间映射.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 显微镜的使用方法
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 由于光参数的限制,传统组织学在分析免疫细胞多样性方面受到限制.
- 流细胞测量虽然对免疫细胞分析具有强大作用,但会使组织分离,失去关键的空间信息.
- 现有的显微镜技术难以识别需要多个蛋白质标记物的复杂免疫细胞子集.
研究的目的:
- 开发一种扩展光成像参数在组织学中的方法.
- 为了实现高参数,在组织部分进行空间分辨的免疫细胞分析.
- 为了弥合流细胞计的分析能力和组织学空间背景之间的差距.
主要方法:
- 收集了光谱重叠的光体信号,并使用光谱分离来隔离单个光体信号.
- 开发了一种分析管道,从高参数组织学图像中提取单细胞.
- 应用了类似流细胞计的门关策略,以对已识别的免疫细胞子集进行分析和映射,并将其重新映射到组织部分.
主要成果:
- 成功地扩大了在组织学图像中检测到的光参数数量.
- 能够在单细胞层面分析组织部分内独特的光特性.
- 量化了免疫细胞子集的丰富性,并绘制了它们在组织微环境中的相互作用.
结论:
- 组织流细胞计提供了一个强大的方法来研究复杂的免疫群体在组织学.
- 该方法保留了空间信息,同时提供了类似流细胞计的免疫细胞概况.
- 证明了对免疫细胞行为和相互作用的详细调查的潜力.


