从临床样本中快速检测Trichophyton indotineae的双重定量PCR试验

科学领域:

• 医学真菌学 医学真菌学
• 分子诊断学 分子诊断学
• 传染性疾病 传染性疾病

背景情况:

• 三菌 (Trichophyton indotineae) 是一种新兴的病原体,导致广泛的皮肤感染.
• 这些感染对特比纳具有很高的耐药性 (50-70%),需要快速诊断.
• 目前的诊断方法 (培养,分子鉴定) 有很长的回报时间 (10-15天).

研究的目的:

• 在临床样本中开发一种快速,直接检测T. indotineae的方法.
• 为了区分T. indotineae与其他Trichophyton mentagrophytes复合体 (TMC) 种类.
• 为了促进T. indotineae感染的早期诊断和治疗.

主要方法:

• 开发了一种双重定量PCR (qPCR) 试验,结合了T. indotineae特异性的qPCR (TI-qPCR) 和泛皮质植物的qPCR (PD-qPCR).
• TI-qPCR针对内部转录间隔区域的特定多态.
• 该试验使用ΔCq [(TI-qPCR) - (PD-qPCR) ]差异来区分T. indotineae与其他TMC物种,该试验在86个T. indotineae和19个非indotineaeTMC临床样本上得到验证.

主要成果:

• 双重qPCR试验证明了T. indotineae检测的100%特异性, ΔCq截止值为4.5.
• 平均 ΔCq 值为 T. indotineae 的 -1.46 ± 2.1 和非indotineae TMC 的 9.6 ± 2.7 .
• 该试验成功地从临床样本中放大了T. indotineae,将其与其他TMC物种区分开来.

结论:

• 开发的双重qPCR试验提供了一种快速和特定的方法,用于直接检测T. indotineae.
• 与传统方法相比,这种诊断工具可以显著缩短诊断的时间.
• 早期识别T. indotineae使得迅速和适当的治疗成为可能,这对于管理这种新出现的耐药真菌感染至关重要.