主要QTL的识别,验证和候选基因分析,用于小麦中的超数值子
Zhiqiang Wang1,2, Haojie Li1, Xinjian Zhou1
1State Key Laboratory of Crop Gene Exploration and Utilization in Southwest China, Triticeae Research Institute, Sichuan Agricultural University, Wenjiang, Chengdu, 611130, China.
BMC genomics
|July 8, 2024
概括
研究人员在面包小麦中确定了两个主要的定量特征位点 (QTL) 超数 (SS). 一个QTL,QSS.sicau-2A (WFZP-A),以前是已知的,而QSS.sicau-2D是一个新的基因位点,具有TraesCS2D03G0260700作为候选基因.
科学领域:
- 植物遗传学 植物遗传学
- 农作物科学 农作物科学
- 分子育种是一种分子育种.
背景情况:
- 每个尖的尖数量是影响面包小麦 (Triticum aestivum L.) 产量的关键特征.
- 识别spikelet数量的定量特征位置 (QTL) 对于推进分子育种策略至关重要.
研究的目的:
- 在面包小麦中识别和表征与超数 (SS) 属性相关的QTL.
- 通过不同遗传背景验证已识别的QTL,并探索候选基因.
主要方法:
- 利用了四个从具有SS表型的共同父系衍生出的重组杂交系 (RIL) 种群.
- 用于在2A和2D染色体上进行QTL映射的大量分离性外体序列测序 (BSE-Seq).
- 开发了分子标记器,用于精细绘制和验证QTL在不同的遗传背景.
主要成果:
- 绘制了两个重要的QTL:染色体2A上的QSS.sicau-2A和染色体2D上的QSS.sicau-2D.
- QSS.sicau-2A被缩小到7.6 Mb的区域,解释了13.7-15.9%的表型变异.
- QSS.sicau-2D被缩小到2.4 Mb的区域,解释了相当大的27.4-32.9%的表型变异,并被确定为一个新的位置.
- 根据表达和序列分析,预测TraesCS2D03G0260700是QSS.sicau-2D的候选基因.
结论:
- 在多个环境中成功识别和验证了两种主要QTL (QSS.sicau-2A和QSS.sicau-2D) 在面包小麦中超数的spikelets特征.
- 确认QSS.sicau-2A为WFZP-A,并确定QSS.sicau-2D为一个新的基因位点,TraesCS2D03G0260700作为未来育种应用的强有力的候选基因.
