细胞边界的全组织成像以亚微米分辨率进行自动细胞分割:在外皮附属体上皮质曲中的应用

科学领域:

• 生物医学成像技术 生物医学成像技术
• 细胞生物学 细胞生物学
• 历史学 历史学 历史学

背景情况:

• 对焦显微镜对于研究细胞和组织结构至关重要.
• 组织的不透明性限制了传统的共聚焦显微镜中的光透到100微米以下.
• 现有的组织清除方法往往无法在高分辨率下保存细胞边界标记.

研究的目的:

• 开发一种新的组织清除方法,可以保存细胞边界标记.
• 为了使清除组织的高分辨率成像使用水浸透目标.
• 为了促进完整组织中的自动3D细胞细分和量化.

主要方法:

• 开发了一种组织清理协议,使其与水的组织折射率相匹配.
• 使用高放大,长距离工作水浸目标.
• 在微米分辨率下应用训练有素的神经网络进行自动化细胞细分.

主要成果:

• 在清除的组织中实现了亚微米分辨率成像.
• 成功保存了细胞边界标记,用于精确的细分.
• 转基因小鼠下和鱼牙结构中的量化3D细胞形态.

结论:

• 这种新方法克服了传统组织清除用于共聚焦显微镜的局限性.
• 能够对3D细胞和组织结构进行高吞吐量量化.
• 为研究器官形态发生和比较解剖学提供了强大的工具.