基因表达特征因小鼠脊椎间盘受伤而受到干扰
Ken Chen1, Zuozhen Tian, Huan Wang
1From the Departments of Orthopedic Surgery (KC, HW, LQ) and Physical Medicine & Rehabilitation (ZT, YZ), University of Pennsylvania, Philadelphia, Pennsylvania; Department of Orthopedics, University of Maryland School of Medicine, Baltimore, Maryland (ME-I); Department of Orthopedics, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, Hunan, P.R. China (KC); Department of Orthopedic Surgery, Tongji Hospital, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, P.R. China (HW); and Section of Rehabilitation Medicine, Corporal Michael J. Crescenz Veterans Affairs Medical Center, Philadelphia, Pennsylvania (YZ).
这项研究使用整个转录组方法确定了参与小鼠椎间盘损伤的新型基因和途径. 这些发现可能会导致新的生物标志物和治疗背痛的治疗点.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 脊椎间盘损伤造成的背部疼痛是一个普遍的临床问题.
- 以前对受伤后早期分子变化的研究依赖候选标记.
- 一种无偏见的全转录组方法提供了对分子变化的全面视图.
研究的目的:
- 用整个转录组分析来识别受椎间盘损伤影响的新型基因和途径.
- 为了比较受伤的基因表达与完整的小鼠尾巴椎间盘之间的基因表达.
- 为了发现潜在的生物标志物和治疗椎损伤的治疗点.
主要方法:
- 在小鼠中,通过针刺引发了椎间盘损伤.
- 使用RNA测序 (RNASeq) 进行了整个小鼠转录组分析.
- 生物信息学方法被用来比较受伤和完整的磁盘的转录组.
主要成果:
- 在 18,078 个基因中,有 592 个被差异性表达 (P.adj < 0.01).
- 升级的基因包括新的候选人,如Chl1和Lum;白细胞迁移是最丰富的生物过程.
- 下调的基因包括4833412C05Rik和Myoc;与细胞骨组织相关的通路最丰富.
结论:
- 一种无偏见的方法在椎间盘损伤后发现了新的,高度调节的基因,可能作为未来的生物标志物.
- 丰富的生物通路和高度连接的分子为伤害后治疗提供了潜在的治疗点.
- 这项研究为了解磁盘损伤的分子格局提供了基础.
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