活动部位 Campylobacter jejuni 酸盐降解酶变体的特征 提供了对酶机制的洞察力
Jing Yang1, Breeanna Mintmier2, Khadanand Kc1
1Department of Chemistry and Chemical Biology, The University of New Mexico, MSC03 2060, 1 University of New Mexico, Albuquerque, New Mexico 87131-0001, United States.
Inorganic chemistry
|July 10, 2024
概括
在X射线吸收光谱检测中,发现了Campylobacter jejuni酸盐还原酶NapA的活性部位. 保存的氨酸残留对酶催化至关重要,它支持氧原子转移机制.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 酶学 是一种酶学.
- 结构生物学 结构生物学
背景情况:
- 坎比洛巴克特 (Campylobacter jejuni) 的酸盐减少酶 (NapA) 对于细菌的呼吸是必不可少的.
- 了解NapA的活性部位结构和催化机制是抑制其功能的关键.
研究的目的:
- 为了阐明野生类型 (wt) NapA和C176A变体中的辅因子的协调环境.
- 研究保存的氨酸残留物 (C176) 在NapA的催化活性和机制中的作用.
主要方法:
- 莫K边缘X射线吸收光谱 (XAS),包括扩展的X射线吸收细结构 (EXAFS).
- 电子偏磁共振 (EPR) 光谱学.电子偏磁共振 (EPR) 光谱学.
- 酶活性的动力学研究.
主要成果:
- 对NAPA质量的EXAFS分析表明,一个具有oxo的六坐标Mo(VI) 活性位点,四个来自pyranopterin dithiolene连接体的硫供体,以及一个cysteine硫.
- 在C176A变体中,表现出一个6坐标活性位点,其中囊硫被氧化物或水连接体所取代.
- C176A变种完全失去了催化活性,EPR研究支持这些结构发现.
结论:
- 保存的C176残留在NapA催化中起着至关重要的作用.
- 纳帕的催化降解酸盐到酸盐可能是通过氧原子转移机制进行的.
- 一个终端硫化连接体不参与纳帕的催化循环.
