使用rDNA ITS2条码来识别来自Mitragyna和Neolamarckiacadamba属的 kratom (Mitragyna speciosa) 植物
Meng-Yi Chen1, Yu-Ching Tu1, Hsin-Yi Shyu1
1Department of Forensic Science, Investigation Bureau, Ministry of Justice, New Taipei City, Taiwan.
Electrophoresis
|July 11, 2024
概括
ITS-p3 / ITS-u4 DNA条形码启动器有效地识别了 kratom (Mitragyna speciosa) 并将其与类似物种 (如Neolamarckia cadamba) 区分开来,即使在混合样本中也是如此. 这种方法对于分析疑似 kratom 粉末来说是优越的.
科学领域:
- 植物学 植物学
- 分子生物学分子生物学
- 法医科学 法医科学 法医科学
背景情况:
- 克拉 (Mitragyna speciosa) 通常以植物粉末的形式出售,这引发了人们对其真实性和纯度的担忧.
- 从形态上相似的物种中区分M. speciosa像Neolamarckia cadamba这样的物种,仅仅通过视觉检查可能是具有挑战性的.
研究的目的:
- 评估两个DNA条形码原始对ITS3/ITS4和ITS-p3/ITS-u4的有效性,用于在怀疑的kratom样本中识别Mitragyna speciosa.
- 为了确定最适合的原料对准确识别kratom和检测潜在的杂物或错误识别的物种.
主要方法:
- 聚合酶链反应 (PCR) 对80个疑似 kratom 样本的核糖体DNA内部转录间隔器 (ITS) 的序列分析.
- 采用了两种基础对:ITS3/ITS4和ITS-p3/ITS-u4.
- 将DNA序列与国家生物技术信息中心 (NCBI-BLAST) 数据库进行了比较.
主要成果:
- ITS3/ITS4初始对确定了40个样本中的35个为M. speciosa,其中5个产生了无法读取的序列.
- ITS-p3 / ITS-u4初始对成功分析了所有80个样本,识别了64个作为M. speciosa具有高可靠性 (99.73-100%匹配).
- 这一初始对还检测到一个样本是Neolamarckia cadamba,另一个样本是M. speciosa和N. cadamba的混合物,根据序列变异来区分它们.
结论:
- ITS-p3 / ITS-u4初始配对比ITS3 / ITS4更有效地识别卡拉 (Mitragyna speciosa),因为它能够从所有样本中产生可读的序列.
- ITS-p3/ITS-u4在区分M. speciosa和N. cadamba和检测混合物方面优越,使其成为分析怀疑kratom植物粉末真实性的首选方法.
