Acinetobacter pittii:从基因组角度分析的医院获得的病原体的出现

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 微生物学 微生物学
• 传染性疾病 传染性疾病

背景情况:

• Acinetobacter pittii越来越多地与严重的医院感染有关.
• 抗生素耐药性,包括碳烯和tigecycline耐药性,是一个重大问题.
• 环境来源,如食物,动物和植物,为这种病原体提供庇护.

研究的目的:

• 分析了来自32个国家的384个临床和非临床来源的Acinetobacter pittii基因组.
• 调查临床A. pittii菌株是否具有有利于医院适应的遗传特征.
• 了解基因组变异性和抗生素耐药性的来源.

主要方法:

• 全基因组测序和对384个A. pittii分离物的比较基因组分析.
• 遗传学分析以确定地理分布和进化关系.
• 抗生素耐药性基因 (ARG) 和毒性因子的识别和表征.

主要成果:

• 在大小和基因含量方面观察到显著的基因组变异性;核心基因组很小 (25-36%).
• 抗生素耐药性和毒性基因主要位于辅助基因组中,通常位于等离子体上.
• 在ARG以外的临床隔离物体中没有发现针对医院环境的特定遗传适应;环境和临床菌株共享类.

结论:

• 在医院获得的A. pittii分离物可能会获得抗生素耐药性基因 (ARG) 由于医疗机构的高选择性压力.
• 核心基因组在环境和医院隔离物之间被保存,这表明了环境储存库.
• A. pittii的全球分布和获得耐药性基因的能力构成了严重的公共卫生威胁.