用来自科威特的新型复合SCC mec元件对CC239-MRSA-III进行测序
Stefan Monecke1,2, Samar Boswihi3, Sascha D Braun4,5
1Leibniz Institute of Photonic Technology (IPHT), Leibniz Center for Photonics in Infection Research (LPI), Jena, Germany. stefan.monecke@uni-jena.de.
概括
在科威特发现的古老流行性黄金葡萄球菌CC239-MRSA-III菌株的新变种携带了edcP-SCC和sasX.等新型遗传元素. 这凸显了这种医院相关病原体的持续演变.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 传染性疾病 传染性疾病
背景情况:
- 金色葡萄球菌CC239-MRSA-III是一种全球流行,古老的医院相关的流行病菌株.
- 最近在科威特 (2019-2022) 的监测发现了一种携带额外复合酶基因 (ccrA/B-2) 的新型变异.
研究的目的:
- 为了阐明新发现的CC239-MRSA-III变异中SCCmec元素的遗传结构.
- 为了研究这个古老的流行病菌株的进化动态.
主要方法:
- 两个S. aureus分离物的纳米孔测序.
- 对测序基因组和已发表数据的生物信息分析.
- 基于微阵列的监控.
主要成果:
- 这种新型变异具有ccrA/B-2基因,以及与SCC相关的基因speG和edcP-SCC.
- edcP-SCC基因与生物膜相关的AAP基因具有结构上的相似性.
- sasX/sesI和氨基糖化物耐药性基因的存在表明它与CC239.9的东南亚类属有关联.
结论:
- 古代流行性CC239菌株继续演变,出现edcP-SCC和sasX阳性变种.
- 这种演变有助于持续的疫情爆发,与社区相关的MRSA.趋势形成鲜明对比.
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