通过使用MALDI-TOF质谱仪将B组Streptococcus分为不同的克隆复合体的自动分类
Lianfen Huang1, Kankan Gao1, Huamin Zhong1
1Department of Laboratory Medicine, Guangzhou Women and Children's Medical Center, Guangzhou Medical University, Guangzhou, China.
矩阵辅助激光吸附/离子化飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 显示了自动化B组链球菌 (GBS) 分类到五个主要的克隆复合体 (CC) 的前景. MSP-M方法为特定的CC提供了更准确的预测.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 质谱测量质量谱测量
- 临床诊断 临床诊断 临床诊断
背景情况:
- 乙组链球菌 (GBS) 是一个重要的病原体,其准确的识别和亚型对临床管理至关重要.
- 目前用于将GBS分类为克隆复合体 (CCs) 的方法可能是劳动密集型的,可能缺乏自动化.
- 矩阵辅助激光吸附/电离时间飞行质谱 (MALDI-TOF MS) 是一种快速识别技术,有可能有进一步的歧视性应用.
研究的目的:
- 评估MALDI-TOF MS的性能,用于将GBS自动分类为五个主要的克隆复合体 (CC).
- 为了比较两种MALDI-TOF基于MS的分类方法的有效性:主要频谱 (MSP) 和MSP-M.
主要方法:
- MALDI-TOF MS分析对来自五个主要 CC (CC10,CC12,CC17,CC19,CC23) 的 167 个 GBS 菌株进行了分析.
- 一个参考集 (n=67) 和一个验证集 (n=100) 用于使用MALDI BioTyper和ClinProTools开发和评估GBS CCs的MSP和MSP-M亚型.
- 通过优化基于信息分类模型的歧视性峰值,生成了GBS CCs的MSP-M亚型.
主要成果:
- 在GBS CC中,MSP-M亚型的积极预测值 (PPV) 比CC10的MSP高 (99.21%和93.65%).
- 对CC12,CC17,CC19的PPV相似,但对使用MSP-M的CC23相比MSP更低.
- 总的来说,MALDI-TOF MS显示了自动化GBS CC分类的潜力.
结论:
- MALDI-TOF MS是一个有前途的工具,用于将GBS自动分类为五个主要的CC,使用MSP和MSP-M.
- 为了准确的预测,GBS CCs分类MSP-M方法是首选的,特别是对于具有高度歧视性峰值的CCs.
- 进一步完善 MALDI-TOF MS 方法可以提高常规 GBS 识别和分类能力.
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