保护cis - 调控语法 底层的Deuterostome 胃流动
Lorena Buono1, Giovanni Annona1,2, Marta Silvia Magri3
1Department of Biology and Evolution of Marine Organisms (BEOM), Stazione Zoologica Anton Dohrn, Villa Comunale, 80121 Naples, Italy.
这项研究揭示了保护的转录因子结合基因,这些基因对多种不同的deuterostomes中胃化至关重要. 这些发现突出了管理早期胚胎发育的保护性调节网络.
科学领域:
- 发展生物学 发展生物学
- 进化基因组学 进化基因组学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 胚胎发育依赖于转录因子和 cis 调节元素之间的精确相互作用.
- 了解这些相互作用是解读形式和功能演变的关键.
研究的目的:
- 分析和比较四个关键的deuterostome物种在胃化期间的cis-regulatory景观.
- 识别保护的转录因子结合基因,对于胃流动至关重要.
主要方法:
- 对ATAC-seq数据集进行比较计算分析.
- 全基因组探索转录因子结合动机.
- 专注于四种物种:强中的紫色,Branchiostoma lanceolatum,Ciona 肠道,和丹尼奥.
主要成果:
- 鉴定了一组保存的DNA结合基因的核心组.
- 这些图案与62个已知的转录因子的关联.
- 在deuterostomes中展示了一个非常保存的胃流调节监管景观.
结论:
- 这项研究强调了基因调节中显著的保护,这也是Deuterostomes中胃流的基础.
- 结果提供了对保存的调控子程序和胚胎发育的进化动态的见解.
更多相关视频
07:34The Power of Simplicity: Sea Urchin Embryos as in Vivo Developmental Models for Studying Complex Cell-to-cell Signaling Network Interactions
Published on: February 16, 2017
07:33A Whole Mount In Situ Hybridization Method for the Gastropod Mollusc Lymnaea stagnalis
Published on: March 15, 2016
相关概念视频
Cis-regulatory Sequences
Gastrulation
Cooperative Binding of Transcription Regulators
Regulation of Expression Occurs at Multiple Steps
Transcription results in the generation of precursor (pre-mRNA) that consists of both exons and introns, which needs further processing before being translated to a...
Master Transcription Regulators
Neurulation
