通过针对性下一代测序基准预植入基因测试,偶然检测到的小拷贝数变异的确认和致病性,以检测状体平台的状体平台

科学领域:

• 生殖遗传学 生殖遗传学
• 基因组变异分析
• 辅助生殖技术是一种辅助生殖技术.

背景情况:

• 在胚胎中识别染色体异常时,对阳化 (PGT-A) 的植入前遗传检测至关重要.
• 针对性下一代测序 (NGS) 平台越来越多地用于PGT-A.
• 在PGT-A期间检测到小副本数变异 (CNV) 作为偶然发现需要进一步评估.

研究的目的:

• 评估基于NGS的PGT-A平台检测到的小型CNV的技术准确性,遗传模式和病原性.
• 确定这些偶然发现的CNV的特异性和发病率.
• 为了评估 PGT-A CNV 调用与父母染色体微阵列分析的一致性.

主要方法:

• 在2020年至2022年期间,对12157名接受临床PGT-A的患者进行了回顾性观察性研究.
• 认定CNV是偶然发现 (在同一周期的≥2个胚胎中,连续≥3个AMPLCON的获取/损失).
• 通过与父母染色体微阵列的一致性来评估准确性,并确定了CNVs的父母起源和致病性.

主要成果:

• 在0.62%的PGT-A患者 (75/12,157) 中偶尔检测到小CNV.
• 在所有确诊病例 (N=65) 中,中核病毒存在于雌性体提供者之一 (100%一致性).
• 冠状病毒被分为良性/可能良性 (40%),意义不明的变异 (46.2%) 或致病性/可能致病性 (13.8%).

结论:

• 基于NGS的有针对性的PGT-A平台在检测遗传小CNV方面表现出高的特异性.
• 虽然大多数检测到的CNV是良性的或具有不确定的意义,但也可以识别致病变体.
• 由于技术挑战,使用当前的PGT-A技术的小型CNV的可靠负预测值仍然未知.