在Pyrus pyrifolia培养品"Sucui 1"中,化和正常花之间的综合甲基组和转录组分析

科学领域:

• 植物分子生物学 植物分子生物学
• 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 细胞因子甲基化是调节植物基因表达的关键表观遗传机制.
• 了解果树花发育中的DNA甲基化对于农业应用至关重要.
• 梨中的枯的花代表了一个重要的发育问题,影响了产量.

研究的目的:

• 以单基底分辨率绘制梨 (Pyrus pyrifolia品种"Sucui 1") 花蕾的全基因组细胞酶甲基化图.
• 为了研究DNA甲基化,基因表达和荷尔蒙水平在正常与色的花之间的关系.
• 为了评估paclobutrazol对DNA甲基化和芽形成的影响.

主要方法:

• 全基因组二硫酸盐测序 (WGBS) 用于单基底分辨率的甲基组映射.
• 转录组分析以将甲基化模式与基因表达相关联.
• 激素量化 (auxin和cytokinin) 和外源性paclobutrazol应用实验.

主要成果:

• 在梨花花芽中观察到19.4%的整体细胞因子甲基化,在CG,CHG和CHH环境中具有明显的模式.
• 促剂甲基化与基因表达减少相关,而基因体甲基化与转录呈负相关性.
• 牛津和细胞因子相关基因的低甲基化与增加的转录和更高的荷尔蒙水平有关. 特定的基因 (PRXP73,CYP749A22,CYP82A3) 显示出促进体低甲基化和上调.
• 帕克洛布特拉治疗通过改变剂量依赖的DNA甲基化和基因表达来降低芽的比例.

结论:

• 基因甲基化在调节梨花花发育期间的基因表达中起着重要作用,影响了发花的发生率.
• 激素相关基因中的异常甲基化模式与色的芽中的奥素和细胞因素水平的改变有关.
• 帕克洛布特拉显示出作为一种农业工具的潜力,通过调节表观遗传修饰来减轻芽的形成.