在db/db小鼠中的过度进食和不活动诱导的肌肉缩的多omics方法

科学领域:

• 代谢学 代谢学 代谢学
• 基因组学就是基因组学.
• 表观基因组学是指表观基因组学.
• 微生物组分析

背景情况:

• 过度进食和不活动是2型糖尿病的关键风险因素.
• Db/db小鼠是研究与肥胖相关的代谢功能障碍的有价值模型.

研究的目的:

• 通过综合的多学科方法,研究2型糖尿病的病理基础.
• 在肥胖和不活动的背景下,探索小肠表观基因组变化的作用.

主要方法:

• 对db/m和db/db小鼠的安置和监测.
• 在骨肌肉和小肠中进行基因表达分析 (mRNA测序).
• 血清细胞因子分析,代谢物分析 (骨肌肉,便,血清) 和肠道微生物群评估 (16S rRNA测序).
• 在小肠上皮细胞中使用CUT&Tag.进行色素修饰分析.

主要成果:

• Db/db小鼠表现出握力降低和内脏脂肪显著增加.
• 基因表达的改变,包括脂质/葡萄糖载体的上调和小肠中的氨基酸载体的下调.
• 肠道微生物组合的变化 (减少Bacteroidetes,增加Firmicutes) 和代谢物概况的改变 (和脂肪酸更高,骨肌肉中的必需氨基酸更低).
• Db/db小鼠表现出与小肠中转载体基因表达相关的独特基因组修饰模式.

结论:

• 综合的奥米克数据显示,肥胖小鼠小肠的显著表观基因组变化.
• 这些表观基因组变化与肥胖和2型糖尿病的背景下不活动诱导的肌肉缩的发病有关.