使用snRNA测序对胎盘组织中的syncytiotrophoblast和trophoblast有机体进行比较分析

科学领域:

• 人类胎盘生物学
• 细胞和分子生物学是细胞和分子生物学.
• 基因组学和转录基因组学

背景情况:

• 合成核细胞 (STB) 是一个多核细胞层,对胎盘功能至关重要.
• 由于其复杂的结构,了解STB分子机制和分化是有限的.
• 对STB基因表达的单细胞水平分析具有挑战性.

研究的目的:

• 确定控制人类STB形成和分化的分子机制.
• 为了比较胎盘组织和热囊细胞有机体 (TOs) 之间的基因表达特征.
• 描述不同的STB核子类型及其功能.

主要方法:

• 在胎盘组织和TOs上的单核 (SN) 和单细胞 (SC) RNA测序的比较.
• 对TO衍生性STB的差异基因表达和伪时间分析.
• 用CRISPR/Cas9基因编辑和大量RNA测序来评估RYBP功能.

主要成果:

• 在捕获STB群体时,SNRNA测序是必不可少的.
• 在TO中确定了三种不同的STB核亚型,反映了体内发现.
• 在TOs中的STB极性 (STB^out与STBⁱⁿ) 影响了基因表达和亚型比例.
• 染色体重塑剂RYBP被确定为一种新的STB分化标志物.
• RYBP淘汰赛影响了CSH1表达和氧感应亚型基因.

结论:

• 热囊细胞有机体是建模STB分化和核亚型的宝贵工具.
• STB基因表达是取决于背景的,响应环境线索.
• 这项研究为研究胎盘健康和疾病中的STB功能提供了一个平台.