在秘鲁亚马逊地区的土著社区中对疟疾寄生虫的基因组监测

科学领域:

• 热带医学 热带医学
• 传染性疾病 传染性疾病
• 寄生虫学的寄生虫学

背景情况:

• 由于传播动态数据有限,秘鲁亚马逊的偏远社区在消除疟疾方面面临重大挑战.
• 这些地区的人口流动性很高,这使得Plasmodium vivax (Pv) 和Plasmodium falciparum (Pf) 的控制策略变得复杂.

研究的目的:

• 评估疟疾传播模式,药物耐药性标志物和Pf hrp2/3基因删除在一个偏远的土著社区新耶路撒冷.
• 了解Pv和Pf寄生虫在这个高度流动性的地区的遗传多样性和种群结构.

主要方法:

• 从2019年11月到2020年5月进行了积极和被动病例检测.
• 使用显微镜,PCR和高度复合的深度测序 (AmpliSeq) 来识别和分析寄生虫.
• 使用种群遗传学,将新耶路撒冷的寄生虫种群与其他偏远的秘鲁地区的寄生虫种群进行比较.

主要成果:

• 在整个研究期间 (96%的天数) 检测到持续的Pv传播.
• Pf寄生虫的遗传多样性和时间聚类较低,包括2020年2月爆发的疫情.
• 在Pf寄生虫中发现了显著水平的黄素 (57%) 和硫素-甲胺 (35-67%) 耐药性,以及常见的pfhrp2/3基因缺失 (32-50%).

结论:

• 该研究强调了正在进行的Pv传播和明显的Pf爆发,强调了人口流动的影响.
• 针对移动和进口感染的定制干预措施对于消除秘鲁亚马逊地区的疟疾至关重要.
• 药物耐药性标志物和基因删除的存在需要仔细监测和适应治疗策略.