在脊柱感染诊断中,应用下一代元基因组测序来快速分子识别
Hui Lv1,2, Sheng Liao1, Zhenzhen Shi3
1Department of Spine Surgery, Jiangbei Branch of Southwest Hospital, 958th Hospital of the PLA Army, Chongqing, China.
Frontiers in cellular and infection microbiology
|July 16, 2024
概括
与传统培养相比,甲基因组下一代测序 (mNGS) 提供了一种更快,更灵敏的方法来检测脊髓感染中的病原体. 推用于mNGS的样,而针对性下一代测序 (tNGS) 对脊髓结核病优越.
科学领域:
- 传染性疾病 传染性疾病
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 脊椎感染带来了诊断方面的挑战.
- 准确和快速的病原体识别对于有效的治疗至关重要.
- 下一代测序 (NGS) 技术为微生物诊断提供了潜在的进步.
研究的目的:
- 评估下一代元基因组测序 (mNGS) 的灵敏度和特异性,以检测脊髓感染.
- 将mNGS的诊断性能与目标下一代测序 (tNGS) 和传统培养方法进行比较.
- 为了确定在脊髓感染中基于mNGS检测病原体的最佳样本类型.
主要方法:
- 对76名怀疑脊髓感染的患者进行了回顾性研究.
- 对mNGS,细菌培养和组织病理学检查进行比较.
- 通过整合临床,病理,成像和实验室数据来确认诊断.
主要成果:
- mNGS的检测率显著高 (77.6%) 和诊断速度更快 (1.65天) 比培养 (18.4%,3.07天).
- mNGS灵敏度 (82.3%) 和准确度 (75%) 优于培养 (17.5%, 27.6%),但特异性较低 (42.9%与76.9%).
- 样本对mNGS产生了更好的结果,而组织样本对培养更好. 针对性NGS (tNGS) 在脊柱结核病诊断方面表现优于mNGS.
结论:
- mNGS是早期开发脊髓感染抗生素治疗方案的宝贵工具,最好采用样.
- tNGS在诊断脊髓结核和识别抗生素耐药性基因方面表现出卓越的性能.
