一种化学选择性丰富策略,以深入覆盖甲基蛋白质组
Lufeng Yan1,2, Manqian Zheng3, Mingzhu Fan4,5
1Department of Chemistry, School of Science, Westlake University, Hangzhou, 310030, Zhejiang Province, China.
Angewandte Chemie (International ed. in English)
|July 16, 2024
概括
这项研究引入了一种用于丰富单甲基素 (Kme1) 的新型化学选择性策略,显著推进了素甲基化位点的识别. 新方法揭示了超过1万个Kme1,揭示了氨酸甲基化对细胞功能的更广泛影响.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 翻译后修饰 (PTMs) 对细胞功能至关重要.
- 氨酸甲基化是一个重要的PTM,但目前的方法确定有限的网站.
- 酸化和乙化等PTM的现有丰富技术是有效的,但氨酸甲基化仍然不足.
研究的目的:
- 开发一种高度敏感和化学选择的方法来丰富单甲基素 (Kme1) .
- 扩大对氨酸甲基化位点的识别,并了解它们对细胞的影响.
- 调查氨酸甲基化对S-adenosyl metionin (SAM) 的依赖性.
主要方法:
- 为Kme1丰富而开发一种基于aryl diazonium的化学选择性策略.
- 使用液体染色学-质谱学/质谱学 (LC-MS/MS) 进行鉴定.
- 使用同位素标记实验来评估SAM的依赖性.
主要成果:
- 从各种细胞系和小鼠组织中鉴定了超过1万个Kme1.
- 展示了Kme1丰富的非凡灵敏性和共价键形成.
- 发现了大量独立于SAM的甲基标记.
结论:
- 新的化学选择性策略显著提高了氨酸甲基化位点的识别.
- 氨酸甲基化在细胞过程中扮演着比以前理解的更广泛的角色.
- 氨酸甲基化的很大一部分不依赖SAM,这表明了替代的调节机制.
