评估crAssphage作为SARS-CoV-2的生物变量 在废水监测中的数据正常化

科学领域:

• 环境微生物学环境微生物学
• 病毒学 病毒学
• 公共卫生监督是对公共卫生的监督.

背景情况:

• 基于废水的流行病学 (WBE) 对公共卫生监测至关重要.
• 准确的规范化对于可靠的WBE数据解释至关重要.
• 交叉组装的菌体 (crAssphage) 已经成为WBE的潜在内源控制.

研究的目的:

• 评估crAssphage作为一种内源性控制来规范SARS-CoV-2废水数据.
• 评估多变量正常化分析对SARS-CoV-2 WBE的影响.
• 为了确定crAssphage正常化是否改善与临床疾病趋势的相关性.

主要方法:

• 在一年内从八个废水处理厂收集了188个原始污水样本.
• 使用N1和N2目标区域进行定量SARS-CoV-2RNA.
• 量化了crAssphage度和应用了多变量规范化分析.

主要成果:

• 在94%的样本中检测到SARS-CoV-2RNA (中位数为5 log10 GC l-1).
• 在100%的样本中检测到crAssphage (中位数9.46 ± 0.40 log10 GC l-1),显示了变化.
• CrAssphage正常化与临床病例有相关性;人均流量正常化增强了这种相关性.

结论:

• CrAssphage是一种可行的内源控制,用于SARS-CoV-2废水监测.
• 使用crAssphage和人均流量的规范化提高了WBE的准确性.
• 加强规范化加强了废水监测对疾病趋势监测的实用性.