内生菌和生菌的元编码显示了肯尼亚的果仁植物圈上的真菌群落
Dennis Wamalabe Mukhebi1, Colletah Rhoda Musangi1, Everlyne Moraa Isoe1
1Department of Biochemistry and Biotechnology, Pwani University, Kilifi, Kenya.
PloS one
|July 17, 2024
概括
果植物界真菌群落,无论是型还是内型,在不同的植物器官中显示出不同的组成和网络结构. 这项研究揭示了果仁树内特殊的真菌协会,影响宿主健康和生态系统功能.
科学领域:
- 植物与微生物的相互作用
- 菌社区生态学 菌社区生态学
- 生物圈微生物学 生物圈微生物学
背景情况:
- 植物拥有多样化的微生物群落,影响健康和生态系统的稳定性.
- 植物界真菌群落 (表层和内层) 是至关重要的,但人们对它们的理解很少.
- 了解这些社区对于果的生产力和管理至关重要.
研究的目的:
- 在果植物圈中表征型和内型真菌群落.
- 为了比较社区组成和网络结构跨不同的果仁器官 (叶子,花,水果).
- 识别关键的真菌分类种及其生态作用.
主要方法:
- 内部转录间隔器 (ITS) 和28S rRNA基因大片的Illumina Miseq测序.
- 将序列聚类为操作分类学单位 (OTU).
- 类似性分析 (ANOSIM) 和网络分析,以评估社区差异和结构.
主要成果:
- 鉴定了267个ITS和108个28S rRNA基因OTU,其中主导的是Ascomycota和Basidiomycota.
- 类Saccharomycetes和Dothideomycetes是最丰富的,具有萨帕特罗夫和病变性功能.
- 在植物界器官之间观察到真菌社区组成的显著差异.
- 长生菌和内生菌的真菌网络是专门的,模块化的,连接较少的.
结论:
- 果植物圈真菌群体表现出不同的型和内型结构.
- 社区的组成在不同的植物器官之间有很大的差异.
- 这些发现为了解果仁树上宿主特异性真菌群体提供了基础.
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