审查SNP测试用于灾难受害者识别:为决策者提供成本,时间和性能信息

科学领域:

• 法医科学 法医科学 法医科学
• 遗传学 是一个遗传学.
• 灾难受害者识别 灾难受害者识别

背景情况:

• 法医DNA实验室必须准备在大规模灾难事件中进行快速反应,以识别尸体.
• 传统的短串重复 (STR) 打字可能在灾难场景中常见的退化DNA样本中效果较差.
• 包括大规模并行测序 (MPS) 在内的DNA测序技术的进步为法医应用提供了新的能力.

研究的目的:

• 评估商业上可用的单核酸多态化 (SNP) 测序试验,用于灾难受害者识别 (DVI).
• 使用数据模拟探索各种SNP面板大小的亲属关系预测潜力.
• 为选择SNP系统用于DVI准备的实验室提供决策矩阵,考虑预测潜力,成本和吞吐量.

主要方法:

• 商业上可用的SNP测序试验适合DVI.的审查.
• 数据模拟以评估不同SNP面板大小的亲属关系预测能力.
• 对DVI场景的分析,以将SNP测试选项的评估置于背景.

主要成果:

• 与STR相比,单核酸多态 (SNP) 显示了与退化DNA的成功率提高的潜力.
• 数据模拟表明基于SNP面板大小的亲属关系预测潜力的不同水平.
• 提出了一个框架,以基于亲属性预测,成本和吞吐量来比较SNP测试选项.

结论:

• 特别是在使用大规模并行测序 (MPS) 平台时,SNP类型化是一种可行且可能优于STR类型化用于灾难受害者识别 (DVI) 的替代方案.
• 对于DVI准备的SNP试验的选择应该平衡亲属关系的预测能力,经济因素和实验室吞吐量.
• 这项研究有助于法医实验室在战略规划和选择适当的SNP-based方法来应对灾害.