鉴定口腔平中差异表达的激活记忆CD4+T细胞相关基因和ceRNAs的鉴定
Hui Zhu1, Huanping Lu1, Tianyou Li1
1Department of Clinical Laboratory, Shanghai Ninth People's Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai, China.
Heliyon
|July 18, 2024
概括
这项研究确定了三种关键基因 (APP,IL1B,TF),与口腔平坦体 (OLP) 中激活记忆CD4+T细胞的低透有关. 这些发现为OLP提供了潜在的治疗目标.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 口腔病理学 口腔病理学
背景情况:
- 口腔平坦 (OLP) 是一种慢性口腔粘膜疾病,具有显著的恶性转变率.
- OLP的确切病因和免疫病原发生在很大程度上仍未确定.
- 了解OLP背后的分子机制对于开发有效的治疗方法至关重要.
研究的目的:
- 在口腔平坦 (OLP) 病理生理学中研究与免疫细胞相关的分子机制.
- 通过生物信息学分析识别与OLP相关的关键基因和途径.
- 探索OLP的潜在诊断标记和治疗点.
主要方法:
- 使用基因表达总量 (GEO) 数据集 GSE52130 进行全面的生物信息学分析.
- 使用CIBERSORTx进行免疫细胞透分析.
- 进行了基因组丰富分析 (GSEA),基因本体学 (GO) 丰富,并构建了蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络.
主要成果:
- 在OLP中鉴定了595个差异表达基因 (DEG),富含质化,先天免疫力和生物氧化.
- 在OLP中发现激活记忆CD4+T细胞的透减少.
- 选择了具有高诊断价值的三个枢纽基因 (APP,IL1B,TF),涉及MAPK和NF-kappaB信号通路和铁代谢.
结论:
- 在OLP中确定了三种激活的记忆CD4+T细胞相关的差异表达基因 (DEGs).
- 这些基因为OLP病原体提供了新的见解.
- 已识别的基因和途径代表了OLP的潜在治疗点.
