病毒的波林顿类超群:进化,分子生物学和分类学
Eugene V Koonin1, Matthias G Fischer2, Jens H Kuhn3
1National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, National Institutes of Health, Bethesda, Maryland, USA.
波林顿是一组移动基因元素,被重新分类为具有双重生活方式的病毒. 这项研究提出了一种新的病毒分类学,将多与其他DNA病毒联系起来,并揭示了进化关系.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 波林顿是编码病毒结构蛋白的真核转位子,暗示了双转位子/病毒性质.
- 它们被归类为拟议的病毒类Polintoviricetes,类Preplasmiviricota.
- 相关元素包括腺病毒,波林顿类病毒 (PLV),病毒细胞和真菌等离子体.
研究的目的:
- 为了研究病毒的波林顿类超群内的进化关系.
- 根据基因组学和结构分析,为这些元素开发一个修改后的巨型taxonomy.
- 为了澄清细菌和真核DNA病毒之间的联系.
主要方法:
- 对波林顿类元素和相关病毒的族系学分析.
- 编码由多子的病毒蛋白质的比较结构分析.
- 利用进化见解构建一个新的病毒分类学.
主要成果:
- 在polinton编码的蛋白质中识别保存的功能域,包括终端蛋白和蛋白酶.
- 澄清了波林托病毒种中的进化关系.
- 建立了一个新的病毒大taxonomy,Polisuviricotina,包括Polintoviricetes,PLVs,病毒细胞和腺病毒.
结论:
- 类似波林顿病毒的病毒代表了一个重要的病毒超级组,提出了双重生活方式.
- 修订后的分类学为了解真核细胞DNA病毒的进化和多样性提供了一个强大的框架.
- 这项研究弥合了细菌和真核病毒的进化,突出了深层次的进化联系.
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