非洲最大的鼠属Bathyergus的遗传多样性. 一个,两个或四个物种?
R Šumbera1, M Uhrová1, G Montoya-Sanhueza2
1Department of Zoology, Faculty of Sciences, University of South Bohemia in České Budějovice, Czech Republic.
Molecular phylogenetics and evolution
|July 19, 2024
概括
对沙丘鼠 (Bathyergus) 的遗传分析表明,尽管以前有分类,但只有一种物种,B. suillus. 基因流动和浅层的族群地理结构支持这一结论,有证据表明最近的一个血统的人口下降.
科学领域:
- * 动物学 动物学
- * 进化生物学 进化生物学
- * 遗传学 在遗传学方面
背景情况:
- * 属 *Bathyergus*包括独特的,大型的,独居的非洲鼠,具有明显的形态和运动适应性.
- *巴瑟格斯的分类学分类是有争议的,公认的物种从两种 (*B. suillus*, *B. janetta*) 到单一的单型物种,最近的分子研究表明多达四种神秘物种.
- *以前的研究表明,巴瑟格斯属内存在神秘的遗传多样性,因此需要进一步研究物种界限和进化史.
研究的目的:
- * 通过使用全面的遗传数据,研究Bathyergus属内的物种多样性和系遗传关系.
- *通过分析种群遗传多样性和基因流动,澄清巴瑟格斯的分类地位.
- * 确定属内分歧的进化时间表,并评估植物地理结构.
主要方法:
- *分析线粒体和全基因组核DNA数据,这些数据来自Bathyergus分布的种群.
- * 遗传学分析,包括共同祖先矩阵构造和Infomap集群.
- *环境利基模型和贝叶斯天际线图分析,以推断人口动态和息地偏好.
主要成果:
- *遗传数据揭示了巴瑟格斯 (Bathyergus) 内部不同的血统,同时也显示了它们之间的显著基因流动.
- *发现 *Bathyergus janetta* 种类在 *Bathyergus suillus* 内部化,使后者变身,有线粒体内侵入的证据.
- * 浅层的族群地理结构,最近的差异估计 (0.82万年),以及广泛的哈普洛型共享表明,谱系之间的基因学区分很低,支持单一物种分类.
- * 环境利基模型证实了对高碳含量的沙土的依赖.
- *贝叶斯天际线图表明,最近B. janetta血统的人口下降,可能与气候变化有关.
结论:
- *这项研究支持识别单一物种,Bathyergus suillus,包括之前描述的B. janetta.
- * 基因流动和浅层遗传结构的证据挑战了在属内传统的物种划分.
- *最近B. janetta血统的数量下降凸显了环境变化对该物种的影响.


