使用临床标本进行向纳米孔测序,以快速诊断肺外结核病
Guocan Yu1, Likui Fang1, Yanqin Shen1
1Zhejiang Tuberculosis Diagnosis and Treatment Center, Hangzhou Red Cross Hospital, Hangzhou, Zhejiang, China.
BMC infectious diseases
|July 19, 2024
概括
向纳米孔测序 (TNS) 为诊断肺外结核 (EPTB) 提供了一种高度准确的方法. 这种快速诊断方法在各种样本类型中被证明是有效的,有助于及时管理患者.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组医学是基因组医学.
- 传染性疾病 传染性疾病
背景情况:
- 肺外结核 (EPTB) 呈现异常,经常模仿其他感染,造成诊断挑战.
- 迅速和准确的EPTB诊断对于有效的患者治疗和管理至关重要.
- 目前用于EPTB的诊断方法可能很慢,缺乏足够的灵敏度.
研究的目的:
- 评估针对肺外结核 (EPTB) 的向纳米孔测序 (TNS) 的诊断准确性.
- 评估TNS在不同类型的肺外样本中的表现.
- 为了比较TNS的诊断准确性与常规的酸快细菌 (AFB) 培养和临床诊断.
主要方法:
- 从149名疑似EPTB的患者接受TNS的临床数据的回顾性审查.
- 诊断准确度指数的计算:灵敏度,特异性,正预测值 (PPV),负预测值 (NPV) 和曲线下的面积 (AUC).
- 将TNS性能与AFB培养和临床诊断进行比较.
主要成果:
- 对于EPTB,TNS的整体诊断准确度很高,灵敏度为86.4%,特异性为87.5%,PPV为97.3%,NPV为55.3%,AUC为0.87.
- AFB培养显示灵敏度较低 (25.6%),但具有完美的特异性 (100.0%) 和PPV (100.0%),AUC为0.63.
- 在包括淋巴结组织,脑脊液和肺部液/组织在内的各种标本中,TNS表现出良好的诊断性能.
结论:
- 向纳米孔测序 (TNS) 是用于快速准确诊断肺外结核 (EPTB) 的一个有价值的工具.
- 在不同类型的肺外样本中,TNS的诊断效果是一致的.
- 与传统方法相比,TNS在诊断EPTB方面提供了显著的进步.
