优化一个合适的协议,以隔离来自组织的细胞外囊泡,并在肝细胞癌中分析小RNA模式
Wenjing Yang1, Yu Liu1, Jiyan Wang1
1Department of Laboratory Medicine, Zhongshan Hospital, Fudan University, Shanghai, China.
概括
一个新的协议有效地隔离了来自瘤组织的细胞外囊泡 (EVs). 这些EV在肝细胞癌 (HCC) 中显示出不同的小RNA配置文件,为HCC进展提供潜在的诊断生物标志物和治疗点.
科学领域:
- 细胞外囊泡 (EV) 研究研究
- 癌症生物学 癌症生物学
- 分子诊断学 分子诊断学
背景情况:
- 细胞外囊泡 (EVs) 在瘤微环境中调解细胞-细胞通信.
- 标准化和有效地隔离瘤组织衍生的EV仍然是一个挑战.
- 瘤衍生的EVs的生物功能尚未完全理解.
研究的目的:
- 优化一种用于隔离组织衍生的EVs的方法.
- 用不同的方法来描述和比较使用不同方法隔离的EV.
- 为了确定来自肝细胞癌 (HCC) 的EV中的差异小RNA含量与相邻的正常肝组织 (ANLTs) 的差异.
主要方法:
- 使用传输电子显微镜,纳米粒子跟踪分析和纳米流分析的三个EV隔离协议的比较.
- 小RNA微阵列分析以识别来自HCC和ANLTs的EV中的差异性小RNA含量 (包括tsRNA).
- 生物信息分析包括目标预测,功能丰富 (GO,KEGG) 和生存分析.
主要成果:
- 一个基于微分离心的协议没有细胞培养 (NC协议) 产生更高的EV粒子和CD9+/CD63+ EV度.
- 该NC协议有效地从新鲜和冷的HCC组织中分离了EVs.
- 与ANLT衍生的EV相比,HCC衍生的EV显示出明显更高的粒子数量和独特的小RNA配置文件.
- 在HCC EVs中,一个由10个上调小RNA组成的小组显示出高诊断性能 (AUC=0.950).
- 参与脂质代谢重编程的下调,线粒体衍生的tsRNAs在HCC EVs中突出.
结论:
- 该NC协议是最佳的隔离EVs从HCC,包括冷组织.
- 在EV中的差异小RNA含量为HCC进展和细胞间通信提供了洞察力.
- 来自EV的小RNA代表了HCC诊断和治疗点的潜在生物标志物.
