细菌转录剖析的临床试点作为一种组合的基因型和表型抗菌感应性测试

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 临床诊断 临床诊断 临床诊断
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 抗菌素耐药性 (AMR) 是一个关键的全球健康挑战.
• 目前的抗生素敏感性测试 (AST) 方法耗时,延迟了对严重感染 (如细菌血症) 的有效治疗.
• 快速的AST对于优化患者护理和打击耐药病原体传播至关重要.

研究的目的:

• 评估新型GoPhAST-R试验的临床可行性和性能,以快速分析抗生素敏感性.
• 评估测试同时提供基因型和表型抗性数据的能力,直接从阳性血液培养物中获取.
• 为了比较GoPhAST-R的结果与标准抗微生物敏感性测试 (AST) 方法.

主要方法:

• 一项临床试点研究对42种阳性血液培养 (26种*大肠杆菌*,15种*肺炎菌) 进行.
• 阳性血培养量被暴露在9种抗生素中,随后使用NanoString®平台进行了快速转录分析.
• 用内部算法分析结果,以分类细菌易感性和检测耐药基因.

主要成果:

• GoPhAST-R显示了95%的总体一致性与标准AST方法.
• 测试显示,对β-乳糖胺 (98%) 的高度同意,对诺基诺 (88%) 的中度同意.
• 成功检测到关键的流行病抗性基因,如CTX-M-15和KPC.

结论:

• 在临床上,GoPhAST-R试验可用于快速和全面的抗生素敏感性确定.
• 这种方法整合了表型和基因型信息,在AST方面取得了重大进展.
• 需要对更大,多样化的细菌群体进行进一步验证,以确定其充分的临床效用.