多种药物耐药的Shigella flexneri疫情与对非人类灵长类动物的高死亡率溢出事件相关

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 流行病学 流行病学

背景情况:

• 石病是一种胃肠道感染,由石菌物种引起.
• 在新墨西哥州阿尔伯克基发生了Shigella flexneri血清型2a的重大疫情,时间跨度从2021年5月到2023年11月.
• 疫情涉及当地动物园的人类群体和非人类灵长类动物 (NHP).

研究的目的:

• 为了分析Shigella flexneri 2a爆发的基因组流行病学.
• 调查人类和NHP种群之间的传播动态.
• 评估疫情孤立的抗菌素耐药性模式.

主要方法:

• 全基因组测序202个人类和4个来自新墨西哥州的NHP Shigella flexneri分离物.
• 分析了来自其他州的15个相关隔离物.
• 基因组比较以确定菌株身份和传播联系.

主要成果:

• 疫情涉及一种多药耐药的Shigella flexneri 2a菌株,在人类和NHP分离物中是相同的.
• 在人类和NHP之间观察到传播,这导致了两者的高发病率和死亡率.
• 人类病例主要影响无家可归者 (PEH) 在与男性发生性关系的男性 (MSM) 首次检测后.
• 近70%的人类病例需要住院治疗,其中有一例死亡.
• 在动物园中记录了6例NHP死亡.

结论:

• 这项研究表明,多药耐药的Shigella flexneri菌株在人类和NHP之间进行了物种间传播.
• 抗微生物耐药性对脆弱的人类和灵长类动物群体构成重大威胁.
• 在One Health框架内进行基因组监测对于检测和管理这种疫情至关重要.