多个马赛克调用器的应用改善了从外体测序数据的后异位突变检测
Nandini G Sandran1, Dani L Fornarino1, Mark A Corbett1
1Neurogenetics Research Program, Adelaide Medical School, University of Adelaide, Adelaide, SA, Australia; Australian Collaborative Cerebral Palsy Research Group, Robinson Research Institute, University of Adelaide, Adelaide, SA, Australia.
概括
新的管道准确地检测父母和孩子的后异位变异 (PZVs),改善单一性疾病的遗传诊断和复发风险估计. 这项研究增强了对家庭遗传变异的理解.
科学领域:
- 遗传学 遗传学 是一个
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 后异位变异 (PZVs) 对于理解遗传疾病至关重要,但很难识别.
- 目前用于PZV检测的方法并未系统地应用于单基性疾病.
- 准确分类de novo变异对于遗传诊断至关重要.
研究的目的:
- 开发和验证用于检测PZVs的管道在父母 (gonosomal mozaicism,pGoM) 和儿童 (体质 mozaicism,M3) 中.
- 在适当的情况下,将生殖系新变种重新归类为马赛克.
- 评估PZV在大型遗传数据集中的流行程度和影响.
主要方法:
- 将PZV检测管道应用于来自澳大利亚脑麻生物库和西蒙斯简单集合的外体组序列数据.
- 经过验证的候选马赛克变体使用深度安普利康测序或滴滴数字PCR.
- 分析的变种分类和报告的新型PZVs.
主要成果:
- 检测到的PZV的高验证率 (pGoM高达92.7%,M3三组高达69.2%).
- 在澳大利亚脑麻生物库中,很大一部分人携带真阳性PZV (16.6%的受试者,20.7%的家长).
- 将3.7%至8.0%的生殖线de novo变种重新归类为马赛克,许多PZV以前未报告.
结论:
- 现有的方法经常错误分类或错过PZVs.
- 开发管道的系统应用可以增加遗传诊断率.
- 改进的PZV检测有助于估计复发风险和识别新型疾病基因.


