RNA共同表达网络的聚类识别了状细胞癌中的新型长非编码RNA生物标志物

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 是一个遗传学.

背景情况:

• 皮肤状细胞癌 (cSCC) 是一种流行转移性皮肤癌,预后不佳.
• 目前缺乏转移风险的生物标志物和高级cSCC的向治疗方法.
• 长非编码RNAs (lncRNAs) 越来越多地被认为是它们在癌症发展中的作用.

研究的目的:

• 研究 lncRNAs 在cSCC进展中的作用.
• 确定与cSCC细胞运动和转移相关的新型lncRNAs.
• 探索转移性cSCC的潜在诊断和治疗点.

主要方法:

• 在患者衍生的cSCC细胞系和正常的人类表皮角质细胞上进行了RNA测序.
• 差异基因表达分析确定了与蛋白质编码基因相关的lncRNAs.
• 定量逆转录PCR (qRT-PCR) 在细胞系和瘤中验证了lncRNA表达.

主要成果:

• 确定了6个基因群,其中一个显示细胞运动相关基因的上调.
• 证实了与cSCC细胞运动相关的特定lncRNAs (HOTTIP,LINC00543) 的升级.
• 瘤中HOTTIP和LINC00543表达的增加与头部和部SCC和肺部SCC患者队列的预后较差相关.

结论:

• 已经确定了一组参与cSCC细胞运动的新型lncRNAs.
• 这些lncRNAs代表了预测cSCC转移风险的潜在生物标志物.
• 已识别的lncRNAs可以作为高级和转移性cSCC的治疗点.