通过单细胞和空间转录组分析,对清细胞细胞癌中cuproptosis签名的表征

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 细胞生物学 细胞生物学
• 癌症研究 癌症研究

背景情况:

• 铜,一种新型的依赖铜的细胞死亡途径,与各种癌症有关.
• 在清细胞细胞癌 (ccRCC) 的瘤微环境 (TME) 中,cuproptosis的作用在很大程度上仍未被探索.

研究的目的:

• 调查ccRCC中cuproptosis和TME之间的关联.
• 识别与cuproptosis相关的基因 (CRG) 签名及其在ccRCC中的预后价值.

主要方法:

• 整合来自ccRCC患者的单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 数据集.
• 在ccRCC TME中分析cuproptosis基因表达模式.
• 空间转录组测序 (ST-seq) 用于签名探索.

主要成果:

• 在进展期间,ccRCC组织中的cuproptosis活性下降,但在治疗后恢复.
• 一种与缺氧相关的亚型,HILPDA+ ccRCC1,表现出 cuproptosis 易感性和有利的预后.
• 在HILPDA+ ccRCC1中发现的关键通路包括离子运输,氧物种反应和PD-L1/PD-1轴.

结论:

• 在ccRCC发育和治疗过程中,cuproptosis的动态发生了变化.
• 希尔普达+ ccRCC1 细胞代表了一种对cuproptosis敏感的亚型,具有治疗潜力.
• 免疫抑制细胞和HILPDA+ ccRCC1细胞之间的相互作用通过特定轴形成ccRCC TME,提供新的治疗策略.