使用RAA-CRISPR/Cas13a试验同时检测Helicobacter pylori和克拉里素耐药性突变
Kuocheng Yan1, Xiaohui Wang2, Yao Han1
1State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, Beijing, 100071, People's Republic of China.
Infection and drug resistance
|July 24, 2024
概括
一种新的SHIELD测定方法可以快速检测Helicobacter pylori及其对克拉里胺素的耐药性. 该方法具有高灵敏度和特异性,可快速诊断并指导治疗决策.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 分子诊断学 分子诊断
- 传染性疾病 传染性疾病
背景情况:
- 杆菌感染影响全球50%的人口,导致胃炎和胃癌.
- 抗生素耐药性,特别是对克拉里胺素的耐药性,降低了H. pylori根除率.
- 需要快速,灵敏和易于执行的检测方法来检测H. pylori及其抗生素耐药性.
研究的目的:
- 开发一种同时检测H.pylori和克拉里素耐药性突变的方法.
- 评估开发的测定方法的灵敏度和特异性.
主要方法:
- 使用重新组合酶辅助放大 (RAA) 与标记的原始体来放大H. pylori 23SrRNA片段.
- 采用了CRISPR/Cas13a系统与侧流条相结合,以区分抗性突变.
- 使用qPCR,基因测序和新 SHIELD 方法分析了 28 个唾液样本.
主要成果:
- SHIELD测定检测到A2142G和A2143G两种在50拷贝/μL的清红素耐药性突变,没有与其他细菌的交叉反应.
- 与唾液样本中的qPCR相比,H. pylori检测的预测值达到100%的正值.
- 与基因测序相比,在检测克拉里素耐药性方面显示了84.6%的积极预测值.
结论:
- 这种SHIELD试验具有很高的灵敏度和特异性,用于检测H. pylori和克拉里胺素耐药性突变.
- 这种方法显示出快速检测H. pylori,大规模查和临床治疗指导的潜力.
