一个蛋白质基因组管道用于分析人类病原体Candida albicans中的蛋白质生物合成错误

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 是一个遗传学.

背景情况:

• 菌 (Candida albicans) 是一种机会性真菌病原体,在免疫功能低下的个体中引起显著的发病率和死亡率.
• 它的毒性与温度依赖的生长,形态切换和基因组可塑性等特征有关.
• 一个异质的蛋白质组,由基因组重组和高等位基因变异产生的,有助于表型多样性.

研究的目的:

• 开发和优化用于检测和量化氨基酸错误整合事件在Candida albicans的蛋白质水平的方法.
• 研究蛋白质错误翻译对Candida albicans蛋白质组的范围和影响.
• 用工程菌株和定量报告系统验证发现.

主要方法:

• 开发和优化质谱 (MS) 和生物信息学管道,以检测罕见的氨基酸错误结合事件.
• 在CUG部位进行了基因工程Candida albicans菌株的蛋白质组分析,该菌株在CUG部位具有高氨酸误纳.
• 在体内定量功能增益光报告系统用于验证LC-MS/MS数据.

主要成果:

• 已建立的MS和生物信息管道能够识别蛋白质层面的氨基酸错误整合事件.
• 证实Candida albicans错误地将氨基酸与背景水平高于不同编码位点的氨基酸结合在一起,特别是CUG.
• 证明在CUG位点增加的白错误整合不会影响其他编码子的转化忠实度.

结论:

• 坎迪达白菌的统计蛋白质组比以前估计的更为广泛.
• 由氨基酸错误结合导致的翻译模两可,对Candida albicans的表型多样性和适应潜力作出了重大贡献.
• 环境因素可能通过翻译模糊性进一步调节Candida albicans现象.