皮佩林/γ-环素复合物的驱动力和大规模亲和力计算:从雨采样模拟和DFT计算中获得的机械见解
Pramod Kumar1, Rituraj Purohit1
1Structural Bioinformatics Lab, CSIR-Institute of Himalayan Bioresource Technology (CSIR-IHBT), Palampur, HP 176061, India; Biotechnology division, CSIR-IHBT, Palampur, HP 176061, India; Academy of Scientific & Innovative Research (AcSIR), Ghaziabad, 201002, India.
Carbohydrate polymers
|July 24, 2024
概括
使用循环德克斯特林 (CD) 来解决piperine (PiP) 的溶解问题. 奥克塔基斯-S-γ-CD显示出最好的复杂化,增强了PiP.
科学领域:
- 超分子化学 超分子化学
- 计算化学计算化学
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
背景情况:
- 皮佩林 (PiP) 通过抑制像CYP3A4.4这样的药物代谢酶来增强植物医药的生物可用性.
- 皮佩林具有较差的水溶性,限制了其治疗应用.
- 环极素 (CDs) 广泛用于提高难溶性化合物的可溶性和输送.
研究的目的:
- 为了研究 piperine (PiP) 与 gamma-cyclodextrin (γ-CD) 和其衍生物的复合.
- 评估PiP-γ-CD超分子复合物的热力学和运动稳定性.
- 确定优质的γ-CD衍生品,以增强PiP复杂化和传递.
主要方法:
- 用分子动力学 (MD) 模拟 (1μs) 和采样来探索复杂的结构.
- 使用wB97X-D/6-311+G(d,p) 进行了量子力学 (QM) 计算,以评估结合热力学.
- 对非共价相互作用的分析以及替代剂组对复合稳定性的影响.
主要成果:
- 奥克塔基斯 (6-O-硫) -γ-CD (奥克塔基斯-S-γ-CD) 与PiP (-457.05 kJ/mol) 证明了最高的复合能.
- 基基-γ-CD (HP-γ-CD) 也与PiP形成了稳定的复合体,其复合能为-249.16kJ/mol.
- 对非共价相互作用的详细分析阐明了结合机制和稳定性因素.
结论:
- 与HP-γ-CD和非替代的γ-CD相比,Octakis-S-γ-CD对皮佩林具有优越的宿主能力.
- 这项研究强调了修改后的γ-CDs在改善 piperine 溶解度和输送方面的潜力.
- 了解非共价相互作用对于设计有效的超分子药物递送系统至关重要.


