关于Rhipicephalus microplus卵巢的发育和成熟的转录组数据集
Raquel Cossío-Bayúgar1, Estefan Miranda-Miranda1, Hugo Aguilar-Díaz1
1Centro Nacional de Investigaciones Disciplinarias en Salud Animal e Inocuidad, Instituto Nacional de Investigaciones Forestales Agrícolas y Pecuarias (INIFAP). Boulevard Cuauhnahuac No. 8534, Jiutepec, Morelos 62574, Mexico.
Data in brief
|July 25, 2024
概括
这项研究分析了牛卵巢在不同发育阶段的基因表达,识别了数千个单基因,编码区域和转录因子. 这些发现提供了关于的繁殖和生理学的见解.
科学领域:
- 关节动物基因组学
- 生理学 生理学
- 生殖生物学 生殖生物学
背景情况:
- 牛 (Rhipicephalus microplus) 对畜牧业构成了重大的经济挑战.
- 了解的基因表达对于开发有效的控制策略至关重要.
研究的目的:
- 在Rhipicephalus microplus卵巢中进行差异基因表达分析.
- 识别与繁殖和一般生理学相关的基因.
主要方法:
- 收集了来自三个发育阶段的卵巢和整个的卵巢.
- 净化了RNA,并使用mRNA合成cDNA进行测序.
- 高通量测序 (Illumina HiSeq) 产生了45.64Gb的数据,产生了82,877个单基因.
主要成果:
- 功能注释在七个数据库 (NR,NT,Swissprot,KOG,KEGG,GO,InterPro) 中发现了单基因.
- 预测编码区域 (CDS),简单序列重复 (SSR) 和转录因子 (TF) 被确定.
- 数据为了解的繁殖和生理过程提供了基础.
结论:
- 生成的转录组数据为Rhipicephalus microplus研究提供了宝贵的资源.
- 这项研究有助于识别参与繁殖和生理学的关键基因.
- 这些发现可以帮助开发新的虫控制方法.
