在大学校园的废水和呼吸道病毒病原体的临床监测
Steven C Holland1, Matthew F Smith1, LaRinda A Holland1
1Center for Fundamental and Applied Microbiomics, Biodesign Institute, Arizona State University, Tempe, AZ, USA.
The Science of the total environment
|July 25, 2024
概括
废水监测检测到在大学校园的人类腺病毒 (HAdV) 爆发. 临床数据证实了HAdV-E4和HAdV-B7基因型,证明了对公共健康的综合监测.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 病毒学 病毒学
- 公共卫生监督是对公共卫生的监督.
背景情况:
- 密集的人口容易感染呼吸道病毒爆发.
- 废水监测提供了一种早期检测社区病原体的方法.
研究的目的:
- 用废水和临床监测在大学校园中监测呼吸道病毒,特别是人类腺病毒 (HAdV).
- 在疫情爆发期间调查HAdV的基因型和传播动态.
主要方法:
- 在2023年22周内,从16个校园地点收集了废水样本,并使用下一代测序进行分析.
- 临床监测涉及123个喉和/或鼻抽样的全基因组测序,这些抽样来自急性呼吸道感染患者.
- 病毒序列中的单核酸多态 (SNP) 被追踪,以将废水信号与临床病例联系起来.
主要成果:
- 在废水中检测到人类腺病毒 (HAdV) 水平的激增.
- 临床监测发现了HAdV基因型E4和B7的爆发.
- 关于HAdV基因型动态和与临床感染相关的比例的废水数据.
- 临床HAdV序列中的SNP与临床呈现同时出现在废水信号中,证实了社区传播.
结论:
- 基于废水的流行病学有效地识别和描述了大学校园中的HAdV疫情.
- 将废水监测与临床数据相结合,提供了一个强大的公共卫生监测系统.
- 这种方法可以帮助管理人口密集地区的呼吸道病毒爆发.
